Sakatlığı nedeniyle sadece iki hazırlık maçında görev aldı

2016-17 sezonunun ikinci yarısında Trabzonspor tarafından kadro dışı bırakılan ve idmanlarını tek başına sürdüren Mehmet Ekici bu sezonun başıyla birlikte Fenerbahçe’ye transfer olmuştu. 8 Temmuz 2017’de Rumen ekibi Juventus Bükreş’e karşı 3-2 kaybedilen maçta 2 gol atarak yıldızlaşan Ekici maçın son bölümünde sakatlanarak kenara gelmişti. Sonraki Sporting CP maçında forma giyemedi.15 Temmuz’da Marsilya’ya karşı son 20 dakika görev alırken başka hazırlık maçında süre almadı.